Деревянная Свято - Троицкая церковь была возведена еще до 1690 г. и имеет свою богатую историю. По данным О.И. Кашика («Из истории заселения…», 1958), попом Торицкой церкви в 1686 г. был Иван Семенов.
В церкви любил бывать, служить и отдыхать первый иркутский епископ, прославленный в лике святых Иннокентий Кульчицкий. Церковь эта сгорела, и вместо неё на том же месте в 1751 г. была построена другая, тоже деревянная, с двумя приделами во имя Живоначальной Троицы и Пророка Божия Илии, с отдельной колокольней на столбах. Эта вторая церковь просуществовала до возведения нового каменного храма и была разработана из-за ветхости в 1833 году. Тогда же на месте этих храмов была установлена часовня.
Новая каменная церковь начала строиться в 1815 году рядом с деревянной, к юго-западу от неё. Храм был окружен оградой и аллеями деревьев-лиственниц, посаженных в 1870 году. В 1910-е гг. Планировочная структура церкви имеет черты барокко - полукруглые алтари приделов лишь наполовину выступают з объема храма. Одновременно уже ощутимо влияние классицизма – это прослеживается в форме полуциркульной апсиды и в декоре фасадов.
В Советское время церковь какое-то время оставалась в ведении общины верующих, однако храм был почти разрушен в годы Советской власти. Его закрывали дважды, сначала в 1932г., но вскоре, по настоятельному требованию населения, опять открыли. Основательно закрыли по итогам заседания культсекции при Иркутском оргкомитете от 27 марта 1983г. Закрытие храма обставлялось внешне вполне законными причинами, главной из которых была официальная просьба приходского собрания закрыть приход, а здание церкви принять на руки государства.
В 1997 г., по ходатайству иркутских епархиальных властей, Троицкая церковь указом губернатора Иркутской области была возвращена верующим. 24 апреля 1997 г. в храм Святой Троицы с. Хомутово был назначен настоятель – иерей В.В. Пушкарев, который возглавил процесс возрождения церкви.